Candida albicans визуализируется с помощью сканирующей электронной микроскопии. Обратите внимание на обильную гифальную массу.

Candida Albicans / Кандида Альбиканс — что это такое? Норма в анализах, полное описание грибка

Candida albicans это условно-патогенный дрожжевой грибок[4], часто обитаетающий в кишечной флоре человека. Кандида альбиканс не распространена широко вне человеческого организма. [5] Она обнаружена в желудочно-кишечном тракте и ротовой полости у 40–60% здоровых взрослых. [6] [7] Обычно это нейтральный грибок, но он может стать патогенным для людей с ослабленным иммунитетом. [7] [8] Это один из немногих видов рода Candida, который вызывает кандидоз человека, вызванный чрезмерным ростом грибка.[7] [8] Кандидоз часто наблюдается у ВИЧ-инфицированных пациентов. [9]

Что значит, если Candida Albicans обнаружена у женщин или мужчин в мазке, какова норма КОЕ?

Если анализ показал наличие кандиды альбиканс в организме, это ещё не означает наличие заболевания. В небольшом количестве эти грибки и их ДНК могут содержаться и у здоровых людей, давая положительный результат в диагностике.

Крупные колонии грибка кандиды
Крупные колонии грибка

Ниже приведена таблица количеств Candida albicans spp в норме и количествах, требующих лечение (Единица измерения — КОЕ/мл.):

  • 10 во 2, 3 степени и менее — норма;
  • 10 в 3 степени — небольшое количество, при хорошем иммунитете нет поводов для тревоги;
  • От 10 в 3 степени до 10 в 4 степени — умеренное количество;
  • 10 в 5, 6 степени и более — большое количество, необходимо квалифицированное лечение.

Приемлемы единичные колонии грибка Candida albicans, обнаруженные в посеве.

Однако, если их количество превышает 10^4 — 10^5 степени КОЕ, то это означает наличие заболевания: урогенитального кандидоза, либо другой формы заболевания в зависимости от места заражения. Особенно внимательными нужно быть женщинам во время беременности, ведь молочница может впоследствии передаться от матери ребенку.

Полное описание кандиды альбиканс

Candida albicans визуализируется с помощью сканирующей электронной микроскопии. Обратите внимание на обильную гифальную массу.
Candida albicans под электронным микроскопом. Обратите внимание на обильную гифальную массу.

C. albicans — наиболее распространенный вид грибов, выделенный из биопленок, образующихся на имплантированных медицинских устройствах или на тканях человека. [10] [11] C. albicans, Candida tropicalis, C. parapsilosis и C. glabrata вместе ответственны за 50–90% всех случаев кандидоза у людей. [8] [12] [13] Уровень смертности 40% был зарегистрирован для пациентов с системным кандидозом из-за Candida albicans. [14] По одной оценке, заражение кандидозом, полученное в больнице, ежегодно вызывает от 2800 до 11200 смертей в США. [15]

Тем не менее, эти цифры могут не отражать истинную степень ущерба, наносимого этим организмом, учитывая новые исследования, показывающие, что Кандида альбиканс может проникать через гематоэнцефалический барьер. [16] [17]

Candida albicans часто используется в качестве модельного организма в биологии. Обычно его называют диморфным грибом, так как он растет в двух формах: и как дрожжи, и как плесень (гифы). Однако у него есть несколько различных морфологических фенотипов.

Кандида альбиканс долгое время считалась облигатным диплоидным организмом без гаплоидной стадии. Однако это не так. Рядом с гаплоидной стадией C. albicans также может существовать в тетраплоидной стадии. Последний образуется, когда диплоидные клетки C. albicans спариваются, когда они находятся в непрозрачной форме. [18] Размер диплоидного генома составляет приблизительно 29 Мб, и до 70% кодирующих белок генов еще не расшифрованы. [19]

Candida albicans легко культивируется в лаборатории и может быть изучен как in vivo, так и in vitro. В зависимости от среды могут быть проведены различные исследования, так как среда влияет на морфологическое состояние C. albicans. Особый тип среды — CHROMagar ™ Candida, который можно использовать для идентификации различных видов кандиды. [20] [21]

Роль Candida albicans в формировании болезней

Кандида встречается во всем мире, но чаще всего она ставит под угрозу людей с ослабленным иммунитетом, у которых диагностированы серьезные заболевания, такие как ВИЧ и рак. Кандида считается одной из наиболее распространенных групп организмов, вызывающих внутрибольничные инфекции.

Особо опасны пациенты, которые недавно перенесли хирургическое вмешательство, трансплантацию или находятся в отделениях интенсивной терапии (ICU) [65]. Candida albicans это основной источник грибковых инфекций у критически больных или иным образом ослабленных пациентов. [66] У этих пациентов преимущественно развивается кандидоз ротоглотки, что может приводить к недоеданию и мешать всасыванию лекарств. [67]

1 molochnica vo rtu

Передаваться кандида может от матери к младенцу во время родов, воздушно-капельным путем, при бытовом контакте, а также часто в больницах, где пациенты с ослабленным иммунитетом получают грибок от работников здравоохранения и имеют уровень заболеваемости 40%.

Мужчины могут заразиться после секса с женщиной, у которой уже есть вагинальная дрожжевая инфекция. [65] Части тела, которые обычно заражаются, включают кожу, гениталии, горло, рот и кровь. [68]

К отличительным признакам вагинальной инфекции относятся выделения, а также сухое и красное появление слизистой оболочки влагалища или кожи. Кандида продолжает оставаться четвертым наиболее изолированным организмом при инфекциях кровотока. [69] Здоровые люди обычно не страдают (серьезно) от поверхностных инфекций, вызванных локальным изменением клеточного иммунитета, что наблюдается у пациентов с астмой, которые употребляют кортикостероиды.

Поверхностные и местные инфекции 

По статистике около 75% женщин будут страдать от вульвовагинального кандидоза (ВВК) хотя бы раз в жизни, и около 90% этих инфекций вызваны Candida albicans. Это обычно происходит как поверхностная инфекция на слизистых оболочках во рту или влагалище.

Это также может повлиять на ряд других мест. Например, молодые люди с пирсингом в языке более широко заражены этими грибками, по сравнению с не проколотыми. [70]

Для заражения ткани хозяина, обычная одноклеточная дрожжевая форма кандиды альбиканс реагирует на сигналы окружающей среды и превращается в заразную многоклеточную нитевидную форму. Это явление называется диморфизмом. [71]

Кроме того, избыточная инфекция считается суперинфекцией, этот термин обычно применяется, когда инфекция становится агрессивной и очень устойчивой к противогрибковым препаратам.

Инфекция продлевается, когда исходный чувствительный штамм заменяется устойчивым к антибиотикам штаммом. [72]

Известно, что кандидоз вызывает желудочно-кишечные (GI) симптомы, особенно у пациентов с ослабленным иммунитетом или тех, кто получает стероиды (например, для лечения астмы) или антибиотики.

В последнее время появляется новая литература о том, что чрезмерный рост грибка в тонкой кишке у пациентов с ослабленным иммунитетом может вызывать необъяснимые симптомы ЖКТ:

Основной механизм, который предрасполагает к кандидозу тонкого кишечника, неясен. Необходимы дальнейшие исследования как для подтверждения этих наблюдений, так и для изучения клинической значимости чрезмерного роста грибков. [7] [8] [73]

Системные инфекции

Системные грибковые инфекции (фунгемия) в том числе пути Candida albicans стали важными причинами заболеваемости и смертности в ослабленном иммунитете пациентов (например, СПИД, рак химиотерапия, орган или пересадка костного мозга).

Кандида альбиканс часто образует биопленки внутри организма. Такие биопленки C. albicans могут образовываться на поверхности имплантируемых медицинских устройств или органов. В этих биопленках он часто встречается вместе с золотистым стафилококком. [74] [75] [10] [11] Такие мультивидовые инфекции приводят к увеличению смертности. [76]

Кроме того, внутрибольничные инфекции вызванные Candida albicans стали причиной серьезных проблем со здоровьем. [77] [9] Особенно после того, как клетки кандиды попадают в кровоток, может возникнуть высокая смертность, до 40-60%. [9] [78]

Хотя Candida albicans является наиболее распространенной причиной кандидемии (гематогенной грибковой инфекции), в последние годы наблюдается снижение заболеваемости и усиление изоляции видов Candida, не относящихся к Albicans . [79]

Профилактические меры по предотвращению инфекции включают

  1. поддержание хорошей гигиены полости рта,
  2. поддержание здорового образа жизни, включая правильное питание,
  3. осторожное использование антибиотиков,
  4. лечение инфицированных участков
  5. и сохранение кожи сухой и чистой, свободной от открытых ран [80] [81]

Роль C. albicans в болезни Крона

Связь между C. albicans и болезнью Крона была основательно исследована. Исследования продемонстрировали, что члены семей с множественными случаями болезни Крона были более склонны к колонизации Candida albicans, чем члены контрольных семей. [82]

Экспериментальные исследования показывают, что химически индуцированный колит способствует колонизации C. albicans. В свою очередь, колонизация C. albicans генерирует антитела к Saccharomyces cerevisiae (ASCA), увеличивает воспаление, гистологические показатели и провоспалительную экспрессию цитокинов. [83] [84]

Лечение candida albicans

Есть относительно немного препаратов, которые могут успешно лечить кандидоз. [85] [86] Лечение обычно включает в себя: [87]

  • амфотерицин В, эхинокандин или флуконазол при системных инфекциях
  • нистатин при оральных и пищеводных инфекциях
  • клотримазол при кожных и генитальных инфекциях дрожжей [88]

Подобно устойчивости к антибиотикам, устойчивость ко многим противогрибковым препаратам становится проблемой. Новые противогрибковые препараты должны быть разработаны для решения этой проблемы, поскольку доступно только ограниченное количество противогрибковых средств. [89] [85] В отличие от бактерий, грибки часто игнорируются как потенциальная проблема со здоровьем. [90]

Экономические последствия кандидоза

Кандидоз это третья по частоте в мире внутрибольничная инфекцией и она приводит к огромным финансовым последствиям.

Приблизительно 60000 случаев системного кандидоза каждый год в одних только США приводят к затратам в размере от 2 до 4 миллиардов долларов. [91]

Общие затраты на кандидоз одни из самых высоких по сравнению с другими грибковыми инфекциями из-за высокой распространенности. [92] Огромные расходы частично объясняются более длительным пребыванием в отделении интенсивной терапии или больнице в целом. Длительное пребывание до 21 дня по сравнению с не инфицированными пациентами не редкость. [93]

Происхождение названия «Кандида альбиканс»

Candida albicans можно рассматривать как тавтологию «Белеющая белизна». «Кандида» происходит от латинского слова candidus, означающего белый, альбиканс — это настоящее причастие латинского слова albicō, означающего «стать белым».

Поэтому кандидоз и кандиду называют молочницей, по ассоциации с типичным симптомом заболевания: белыми выделениями. Более ста синонимов были использованы для описания C. albicans. [2] [22]

Более 200 видов были описаны в рамках рода Candida. Самое древнее упоминание о молочнице, вероятнее всего вызванное кандидой албиканс, относится к 400 г. до н.э. в работе Гиппократа «Эпидемии», описывающей кандидоз полости рта. [23] [2]

Геном

Candida albicans в чашке с питательной средой
Candida albicans в чашке с питательной средой

Геном C. albicans составляет почти 16 МБ для размера гаплоида (28 МБ для диплоидной стадии) и состоит из 8 наборов пар хромосом, называемых chr1A, chr2A, chr3A, chr4A, chr5A, chr6A, chr7A и chrRA. Второй набор (C. albicans диплоидна) имеет похожие названия, но с буквой B в конце. Chr1B, chr2B… и chrRB. Весь геном содержит 6198 открытых рамок для чтения (ORF). 70% этих ОРС еще не охарактеризованы. Весь геном был секвенирован, что делает его одним из первых грибов, который будет полностью секвенирован (рядом с Saccharomyces cerevisiae и Schizosaccharomyces pombe). [19] [9]

Все открытые рамки считывания (ORF) также доступны в Шлюз-адаптированные векторы. Помимо этого ORFeome также имеется библиотека GRACE (замена генов и условная экспрессия) для изучения необходимых генов в геноме C. albicans. [24] [25] Наиболее часто изучают штаммы WO-1 и SC5314. WO-1 переключается между непрозрачной белой формой с более высокой частотой, тогда как штамм SC5314 используется для эталонной последовательности генов. [26]

Одной из наиболее важных особенностей генома C. albicans является высокая гетерозиготность. В её основе лежит возникновение численных и структурных хромосомных перестроек и изменений как средства генерации генетического разнообразия с помощью полиморфизмов длины хромосом (сокращение / расширение повторов), реципрокных транслокаций, делеций хромосом, несинонимичных однонуклеотидных полиморфизмов и трисомии отдельных хромосомы. Эти кариотипические изменения приводят к изменениям в фенотипе, который является адаптационной стратегией этого гриба. Эти механизмы дополнительно изучаются при наличии полного анализа генома Candida albicans. [27] [28] [29]

Необычная особенность рода Candida заключается в том, что во многих его видах (включая Candida albicans и C. tropicalis, но не, например, C. glabrata) кодон CUG , который обычно определяет лейцин, определяет серин у этих видов. Это необычный пример отклонения от стандартного генетического кода, и большинство таких отклонений находятся в стартовых кодонах или, для эукариот, в митохондриальных генетических кодах. [30] [31] [32] Это изменение может, в некоторых средах, помочь этим Candida видов, вызывая постоянную реакцию на стресс, более обобщенную форму реакции теплового шока. [33] Однако, такое использование кодонов затрудняет изучение белково-белковых взаимодействий C. albicans в модельном организме S. cerevisiae. Чтобы преодолеть эту проблему, была разработана специфическая двухгибридная система C. albicans. [34]

Геном кандиды альбиканс высоко динамичный, обусловлен различной трансляцией CUG. Э-та изменчивость была выгодно использована для молекулярно-эпидемиологических исследований и популяционных исследований у этого вида. Последовательность генома позволила идентифицировать наличие парасексуального цикла (не обнаружено деления мейоза) у C. albicans. [35] Это исследование эволюции полового размножения у шести видов Candida обнаружило недавние потери в компонентах основного пути мейотического кроссовер-образования, но сохранение незначительного пути. [35]

Авторы предположили, что если виды кандиды подвергаются мейозу именно с помощью редуцированного или другого механизма и указывают, что у многих видов могут существовать непризнанные мейотические циклы. В другом эволюционном исследовании введение частичного переопределения идентичности CUG (из видов Candida) в клоны Saccharomyces cerevisiae вызвало стрессовую реакцию, которая негативно повлияла на половое размножение. Считалось, что это переопределение идентичности CUG, происходящее у предков видов Candida, запирает эти виды в диплоидное или полиплоидное состояние с возможной блокировкой полового размножения. [36]

Морфология

Непрозрачная колония Candida albicans, растущая в виде дрожжеподобных клеток с нитевидными клетками сверху
Непрозрачная колония Candida albicans, растущая в виде дрожжеподобных клеток с нитевидными клетками сверху

C. albicans проявляет широкий спектр форм из-за фенотипического переключения и перехода от почки к гифе. Переход дрожжей к гифам (филаментация) — это быстрый процесс, вызванный факторами окружающей среды. Переключение происходит спонтанно с более низкой скоростью, и у определенных штаммов известно до семи различных фенотипов.

Наиболее изучен механизм смены формы переключением белого на непрозрачное (эпигенетический процесс). Дэвид Р. Солл и его коллеги обнаружили две системы (высокочастотная система переключения и переключение белого на непрозрачное) . [37] [38] Переключение в Candida albicans часто, но не всегда, зависит от условий окружающей среды, таких как уровень СО 2, анаэробные условия, используемая среда и температура. [39]

В форме дрожжей размер кандиды альбиканс составляет от 10 до 12 микрон. На псевдогифах, называемых хламидоспорами, могут образовываться споры, которые выживают, когда находятся в неблагоприятных условиях, таких как сухое или жаркое время года. [40]

Переключение между дрожжами и гифами

Круглые, белофазные и вытянутые непрозрачные клетки Candida albicans : масштабная шкала составляет 5 мкм.
Круглые, белофазные и вытянутые непрозрачные клетки Candida albicans : масштабная шкала составляет 5 мкм.

Хотя их часто называют диморфными, Candida albicans на самом деле является полифенической (часто также называемой плеоморфной). [41] При культивировании в стандартной дрожжевой лабораторной среде кандида альбиканс растет в виде яйцевидных «дрожжевых» клеток. Тем не менее, умеренные изменения температуры, содержания CO2, питательных веществ и pH в окружающей среде могут привести к морфологическому сдвигу к нитевидному росту. [42] [43]

Нитевидные клетки имеют много общего с дрожжевыми клетками. Оба типа клеток, по-видимому, играют специфическую, особую роль в выживании и патогенности Candida albicans. По-видимому, дрожжевые клетки лучше подходят для распространения в кровотоке, в то время как гифальные клетки были предложены в качестве фактора вирулентности. Гифальные клетки заразны и предполагают, что они важны для проникновения в ткани, колонизации органов и выживания, а также выхода из макрофагов. [44] [45] [46] Переход от дрожжей к клеткам гифов считается одним из ключевых факторов вирулентности кандиды альбиканс, однако он не считается необходимым. [47] Когда клетки кандиды альбиканс выращиваются в среде, имитирующей физиологическое окружение человека-хозяина, они растут как нитевидные клетки (как настоящие гифы, так и псевдогифы).

Candida Albicans также может образовывать хламидоспоры функция которого остается неизвестной, но предполагается, что они играют роль в выживании в суровых условиях, поскольку они чаще всего образуются в неблагоприятных условиях. [48]

Сигнальный каскад cAMP-PKA имеет решающее значение для морфогенеза. Важным регулятором перехода от дрожжеобразных клеток к нитчатым клеткам является EFG1. [49] [50]

Высокочастотное переключение

В этой модели генетической сети, регулирующей белый непрозрачный переключатель, белые и золотые прямоугольники представляют гены, обогащенные в белом и непрозрачном состояниях соответственно. Синие линии представляют отношения, основанные на генетическом эпистазе. Красные линии представляют контроль Wor1 каждого гена, основанный на обогащении Wor1 в экспериментах по иммунопреципитации хроматина. Активация (стрелка) и репрессия (столбец) выводятся на основании экспрессии белого и непрозрачного состояния каждого гена.
В этой модели генетической сети, регулирующей белый непрозрачный переключатель, белый и золотые прямоугольники представляют гены, обогащенные в белом и непрозрачном состояниях соответственно. Синие линии представляют отношения, основанные на генетическом эпистазе. Красные линии представляют контроль Wor1 каждого гена, основанный на обогащении Wor1 в экспериментах по иммунопреципитации хроматина. Активация (стрелка) и репрессия (столбец) выводятся на основании экспрессии белого и непрозрачного состояния каждого гена.

Помимо хорошо изученного перехода дрожжей в гифы, были описаны другие системы переключения. [51] Одной из таких систем является система «высокочастотного переключения». Во время этого переключения различные клеточные морфологии (фенотипы) генерируются спонтанно. Этот тип переключения не происходит массово, представляет собой систему изменчивости и происходит независимо от условий окружающей среды. [52] Штамм 3153A продуцирует по меньшей мере семь различных морфологий колоний. [53] [54] [55]

Во многих штаммах разные фазы самопроизвольно преобразуются в другие с низкой частотой. Переключение обратимо и тип колонии может наследоваться от одного поколения к другому. Возможность переключения через множество различных (морфологических) фенотипов делает Candida albicans способным расти в разных средах, как в качестве комменсала, так и в качестве патогена. [56]

В штамме 3153A был найден ген под названием SIR2 (для регулятора молчаливой информации), который, по-видимому, важен для фенотипического переключения. SIR2 первоначально был найден в Saccharomyces CEREVISIAE (пивные дрожжи), где она участвует в хромосомных глушителей — a форму регуляции транскрипции, в котором районы генома обратимо инактивированны изменениями в хроматина структуры (хроматин представляет собой комплекс ДНК и белков, составляющих хромосомы).

У дрожжей гены, участвующие в контроле типа спаривания, обнаруживаются в этих молчащих областях, и SIR2 подавляет их экспрессию, поддерживая тихую компетентную структуру хроматина в этой области. Открытие SIR2 у Candida albicans, вовлеченного в фенотипическое переключение, предполагает, что он также имеет молчащие области, контролируемые SIR2, в которых могут находиться специфичные для фенотипа гены. То, как сам SIR2 регулируется у S. cerevisiae, еще может дать больше информации о механизмах переключения C. albicans.

Переключение из белой формы в непрозрачную

Наряду с диморфизмом и первой описанной высокочастотной системой переключения, Candida albicans подвергается другому частому процессу переключения, называемому переключением с белого на непрозрачное, что является еще одним фенотипическим процессом переключения у кандиды альбиканс. Это была вторая система переключения, обнаруженная у C. albicans. [37] Это эпигенетическая система переключения. [57]

Фенотипическое переключение часто используется для обозначения непрозрачного переключения белого, которое состоит из двух фаз: одна, которая растет в виде круглых клеток в гладких белых колониях (называемая белой формой), и другая, которая похожа на палочку и становится плоской, серой колонии (так называемая непрозрачная форма). Этот переход от белых клеток к непрозрачным клеткам важен для вирулентности и процесса спаривания кандиды альбиканс, так как непрозрачная форма наиболее подходит для спаривания, будучи в миллион раз более эффективной чем белый тип. [58] [57] [59]

Это переключение между белой и непрозрачной формой регулируется регулятором WOR1 (от белого к непрозрачному регулятору 1), который контролируется локусом типа спаривания (MTL) репрессор (a1-α2), который ингибирует экспрессию WOR1. [60] Помимо белой и непрозрачной фазы существует еще одна третья: серый фенотип. Этот фенотип демонстрирует высочайшую способность вызывать кожные инфекции. Белые, непрозрачные и серые фенотипы образуют нестабильную фенотипическую систему переключения. Поскольку часто бывает трудно различить белые, непрозрачные и серые клетки, в среду можно добавить краситель флоксин В, краситель. [56]

Потенциальной регуляторной молекулой в переключении белого на непрозрачный является Efg1p, транскрипционный фактор, обнаруженный в штамме WO-1, который регулирует диморфизм, и недавно было предложено помочь регулировать фенотипическое переключение. Efg1p экспрессируется только в белом, а не в сером типе клеток, а избыточная экспрессия Efg1p в серой форме вызывает быстрое превращение в белую форму. [61] [62]

Переключатель White-GUT

Особый тип фенотипического переключателя — переключатель белого кишечника (желудочно-кишечный индуцированный переход). Клетки GUT чрезвычайно приспособлены к выживанию в пищеварительном тракте путем метаболической адаптации к доступным питательным веществам в пищеварительном тракте. Клетки GUT живут как комменсальные организмы и вытесняют другие фенотипы. Переход от белых к GUT клеткам обусловлен проходом через кишку, где параметры окружающей среды запускают этот переход, увеличивая экспрессию WOR1. [63] [64]

Биопленка гриба

Этапы формирования биопленки

Биопленка Candida albicans формируется в четыре этапа. Во-первых, существует начальная стадия присоединения, когда клетки дрожжевой формы прилипают к субстрату. Второй этап называется промежуточным этапом, когда клетки размножаются с образованием микроколоний, а зародышевые трубки образуют гифы.

На стадии созревания биомасса биопленки расширяется, накапливается внеклеточный матрикс и повышается лекарственная устойчивость. На последнем этапе формирования биопленки клетки дрожжевой формы высвобождаются для колонизации окружающей среды (дисперсия). Клетки дрожжей, высвобождаемые из биопленки, обладают новыми свойствами, в том числе повышенной вирулентностью и лекарственной устойчивостью. [94]

Zap1

Zap1, также известный как Csr1 и Sur1 (чувствительный к цинку активаторный белок) необходим для образования гиф в биопленках Candida albicans. Zap1 контролирует равновесие дрожжевых и гифальных клеток, переносчиков цинка и генов, регулируемых цинком, в биопленках C. albicans. [95]

Цинк

Цинк (Zn2 +) важен для клеточной функции Candida albicans, а Zap1 контролирует уровни цинка в клетках через транспортеры цинка ZRT1 и ZRT2. Регулирование концентрации цинка в клетках важно для жизнеспособности клеток, и если уровень цинка становится слишком высоким, это токсично для клеток. ZRT1 транспортирует ионы цинка с высокой аффинностью, а ZRT2 транспортирует ионы цинка с низкой аффинностью. [96]

Механизмы и белки, важные для патогенеза

Филаментация

Способность переключаться между дрожжевыми и гифальными клетками важна для вирулентности. Многие белки играют роль в этом процессе. Филаментация у Candida albicans — очень сложный процесс. [97] Образование гифов может помочь Candida albicans вырваться из макрофагов. [98]

Hwp1

Hwp1 расшифровывается как белок 1 гифальной стенки. Hwp1 — это белок, расположенный на поверхности гиф в гифальной форме Candida albicans. Hwp1 представляет собой субстрат трансглутаминазы млекопитающих. Этот фермент позволяет Candida Albicans стабильно прикрепиться к клеткам. [99] Адгезия Candida albicans к клеткам-хозяевам предшествует  инфекции для колонизации и последующей индукции инфекции слизистой оболочки.

РНК-связывающий белок Slr1

РНК-связывающий белок Slr1 играет роль в образовании гифа и вирулентности в C. Albicans. [100]

Кандидализин (Candidalysin)

Кандидализин представляет собой цитолитический 31-аминокислотный α-спиральный пептидный токсин, который выделяется во время образования гиф. Это способствует вирулентности при инфекциях слизистой оболочки. [101]

Генетические и геномные инструменты

Поскольку кандида альбиканс хороша в качестве модельного организма, являющегося важным человеческим патогеном, было создано несколько конкретных проектов и инструментов для её изучения. [9] Диплоидная природа и отсутствие полового цикла затрудняет изучение организма. Однако за последние 20 лет было разработано много систем для изучения C. albicans на более глубоком генетическом уровне.

Выбор маркеров

Наиболее часто используемым в селекции Candida albicans являются маркер устойчивости к CaNAT1 (к нурсеотрицину) и MPAr или IMH3r ( к микофенольной кислоте). [102]

Было создано несколько ауксотрофных штаммов для работы с ауксотрофными штаммами. Маркер URA3 (бластерный метод URA3) является часто используемой стратегией у ауксотрофных уридиновых штаммов, однако исследования показали, что различия в положении URA3 в геноме могут быть связаны с патогенезом C. albicans. [103]Помимо отбора URA3 можно также использовать аутотрофию гистидина, лейцина и аргинина.

Преимущество использования этих автотрофов заключается в том, что они демонстрируют вирулентность дикого или почти дикого типа в мышиной модели по сравнению с системой URA3. [104] Одним из применений аутотрофии лейцина, аргинина и гистидина является, например, гибридная система Candida Two [105].

Полная последовательность генома

Полный геном C. albicans был расшифрован и обнародован в базе данных Candida. Гетерозиготный диплоидный штамм, используемый для этого проекта с полной последовательностью генома, представляет собой лабораторный штамм SC5314. Секвенирование было выполнено с использованием метода дробовика с целым геномом. [106]

ORFeome проект

Каждая предсказанная ORF была создана в векторе, адаптированном к шлюзу (pDONR207), и стала общедоступной. Векторы (плазмиды) можно размножать в Escherichia coli и выращивать на среде LB + гентамицин. Таким образом, каждый ORF легко доступен в простом в использовании векторе. Используя систему шлюза, можно перенести интересующую ORF на любой другой адаптированный к шлюзу вектор для дальнейших исследований конкретной ORF. [107] [25]

Интегративная плазмида CIp10

В отличие от дрожжей S. cerevisiae эписомальные плазмиды не остаются стабильными у C. albicans. Чтобы работать с плазмидами в C. albicans, необходимо использовать интегративный подход (интеграция плазмиды в геном). Вторая проблема заключается в том, что большинство плазмидных превращений довольно неэффективно у C. albicans, однако плазмида CIp10 преодолевает эти проблемы и может быть легко использована для очень эффективной трансформации C. albicans. Плазмида интегрируется в локус RP10, так как нарушение одного аллеля RP10, по-видимому, не влияет на жизнеспособность и рост C. albicans. Несколько адаптаций этой плазмиды были сделаны после того, как оригинал стал доступен. [108][109]

Candida двухгибридная (C2H)

Из-за аберрантного использования кодонов C. albicans менее целесообразно использовать общий организм-хозяин (Saccharomyces cerevisiae) для двухгибридных исследований. Чтобы преодолеть эту проблему, была создана двухгибридная (C2H) система Candida albicans. Штамм SN152, ауксотрофный по лейцину, аргинину и гистидину, был использован для создания этой системы C2H. Он был адаптирован путем интеграции репортерного гена HIS1, которому предшествовали пять последовательностей LexAOp.

В системе C2H плазмида приманки (pC2HB) содержит Staphylococcus aureus LexA BD, в то время как плазмида добычи (pC2HP) содержит вирус AD AD16. Обе плазмиды являются интегративными плазмидами, поскольку эписомальные плазмиды не остаются стабильными у C. albicans, Репортерный ген, используемый в системе, представляет собой ген HIS1. Когда белки взаимодействуют, клетки смогут расти на среде, в которой отсутствует гистидин из-за активации репортерного гена HIS1. [34] [9] До сих пор было обнаружено несколько взаимодействий с использованием этой системы в низком масштабе. [110] [111] Первый высокопроизводительный скрининг также был выполнен. [112] Взаимодействующие белки можно найти в BioGRID. [113]

Бимолекулярная флуоресцентная комплементация (BiFC)

Помимо системы C2H, была разработана система BiFC для изучения межбелковых взаимодействий у C. albicans. С помощью этих систем белковые взаимодействия могут быть изучены в их естественном субклеточном расположении, в отличие от системы C2H, в которой белки выталкиваются в ядро. С помощью BiFC можно изучать, например, белковые взаимодействия, которые происходят на клеточной мембране. [114]

Микрочипы

Микрочипы ДНК и белка были разработаны для изучения профилей экспрессии ДНК и продукции антител у пациентов против белков клеточной стенки C. albicans. [115] [109]

Библиотека GRACE

Используя тетрациклин-регулируемую промоторную систему, была создана библиотека для замены генов и условной экспрессии (GRACE) для 1152 генов. Используя регулируемый промотор и удалив 1 из аллелей определенного гена, можно было различить несущественные и существенные гены. Из протестированных 1152 генов 567 оказались существенными. Знания об основных генах могут быть использованы для обнаружения новых противогрибковых. [116]

CRISPR / Cas9

CRISPR / Cas9 был адаптирован для использования в C. albicans. [117] Несколько исследований были выполнены с использованием этой системы. [118] [119]

Применение в технике

Candida albicans использовался в сочетании с углеродными нанотрубками (УНТ) для производства стабильных электропроводящих био-нанокомпозитных тканевых материалов, которые использовались в качестве чувствительных к температуре элементов. [120]

Известные исследователи C. albicans

  • Дэвид Р. Солл
  • Нил А.Р. Гоу
  • Фред Шерман

Ссылки на источники

  1. ^ Candida albicans в браузере таксономии NCBI, доступ по URL 2006-12-26
  2. ^ Перейти к: а б в Курцман, КП; Фелл, Джек В. (1998). Дрожжи, таксономическое исследование (4-е изд.). ISBN 978-0444813121.
  3. ^ МакКлари, Дэн Отон (май 1952). «Факторы, влияющие на морфологию Candida Albicans». Летопись ботанического сада Миссури. 39 (2): 137–164. doi : 10.2307 / 2394509. JSTOR 2394509.
  4. ^ Гоу, NAR (2017). «Профиль микробов: Candida albicans: изменчивый, условно-патогенный грибок человека». Микробиология. 163 (8): 1145–1147. doi : 10.1099 / mic.0.000499. PMID 28809155.
  5. ^ Odds, FC (1988). Candida и Candidosis: обзор и библиография (2-е изд.). Лондон; Филадельфия: Bailliere Tindall. ISBN 978-0702012655.
  6. ^ Kerawala C, Newlands C, ред. (2010). Челюстно-лицевая хирургия. Оксфорд: издательство Оксфордского университета. С. 446, 447. ISBN 978-0-19-920483-0.
  7. ^ Перейти к: а б в г Эрдоган А, Рао С.С. (апрель 2015 г.). «Грибок тонкого кишечника». Curr Gastroenterol Rep. 17 (4): 16. doi : 10.1007 / s11894-015-0436-2. PMID 25786900.
  8. ^ Перейти к: a b c d Martins N, Ferreira IC, Barros L, Silva S, Henriques M (июнь 2014 г.). «Кандидоз: предрасполагающие факторы, профилактика, диагностика и альтернативное лечение». Микопатология. 177 (5–6): 223–240. doi : 10.1007 / s11046-014-9749-1. ЛВП : 10198/10147. PMID 24789109.Виды Candida и другие микроорганизмы вовлечены в эту сложную грибковую инфекцию, но Candida albicans продолжает оставаться наиболее распространенным. За последние два десятилетия было замечено, что аномальный чрезмерный рост в желудочно-кишечном, мочевом и дыхательном путях не только у пациентов с ослабленным иммунитетом, но также связан с внутрибольничными инфекциями и даже у здоровых людей. Существует множество причинных факторов, которые способствуют развитию дрожжевой инфекции, что означает, что кандидоз является хорошим примером многофакторного синдрома.
  9. ^ Перейти к: a b c d e f Calderone A, Clancy CJ, eds. (2012). Кандида и Кандидоз (2-е изд.). ASM Press. ISBN 978-1-55581-539-4.
  10. ^ Перейти к: а б Кумамото CA (2002). «Кандида биопленки». Современное мнение в микробиологии. 5 (6): 608–11. doi : 10.1016 / s1369-5274 (02) 00371-5. PMID 12457706.
  11. ^ Перейти к: а б Донлан Р.М. (2001). «Формирование биопленки: клинически значимый микробиологический процесс». Клинические инфекционные заболевания. 33 (8): 1387–92. doi : 10.1086 / 322972. PMID 11565080.
  12. ^ Пфаллер М.А., Diekema DJ (январь 2007). «Эпидемиология инвазивного кандидоза: постоянная проблема общественного здравоохранения». Clin Microbiol Rev. 20 (1): 133–163. doi : 10.1128 / CMR.00029-06. PMC 1797637. PMID 17223626.
  13. ^ Шлехт, Лиза Мари; Фрейберг, Джеффри А.; Хенш, Гертруда М.; Питерс, Брайан М.; Shirtliff, Mark E.; Krom, Bastiaan P.; Filler, Scott G.; Джабра-Ризк, Мэри Энн (2015). «Системная инфекция золотистого стафилококка, опосредованная Candida albicans гифальной инвазией слизистой оболочки». Микробиология. 161 (часть 1): 168–81. doi : 10.1099 / mic.0.083485-0. PMC 4274785. PMID 25332378.
  14. ^ Сингх, Рахна; Чакрабарти, Аруналоке (2017). «Инвазивный кандидоз в Юго-Восточной Азии». В Прасаде, Раджендра. Candida albicans: клеточная и молекулярная биология (2-е изд.). Швейцария: Springer International Publishing AG. п. 27. ISBN 978-3-319-50408-7.
  15. ^ Пфальер, Массачусетс; Дикема, DJ (2007). «Эпидемиология инвазивного кандидоза: постоянная проблема общественного здравоохранения». Клиническая микробиология Отзывы. 20 (1): 133–63. doi : 10.1128 / CMR.00029-06. PMC 1797637. PMID 17223626.
  16. ^ Ву, Ифань; Ду, Шуки; Джонсон, Дженнифер Л.; Тун, Хуэй-Ин; Landers, Cameron T.; Лю Юйвэй; Семан, Бриттани Дж.; Уилер, Роберт Т.; Коста-Маттиоли, Мауро (2019-01-04). «Микроглия и белок-предшественник амилоида координируют контроль над преходящим кандидозным церебритом с дефицитом памяти». Природа Связи. 10 (1). doi : 10.1038 / s41467-018-07991-4. ISSN 2041-1723.
  17. ^ https://medicalxpress.com/news/2019-01-fungi-brain-infection-impair-memory.html
  18. ^ Хикман М.А., Зенг Г., Форче А., Хирасава М.П., ​​Аббатство Д., Харрисон Б.Д., Ван Ю.М., Су Ч., Беннетт Р.Дж., Ван Й., Берман Дж. (2016). «Candid albicans« облигатный диплоид »образует гаплоиды, компетентные в отношении спаривания». Природа. 494 (7435): 55–59. Bibcode : 2013Natur.494… 55H. doi : 10.1038 / nature11865. PMC 3583542. PMID 23364695.
  19. ^ Перейти к: a b «Candida albicans SC5314 Снимок генома / Обзор». www.candidagenome.org
  20. ^ «Развитие Candy albicans Hyphae в разных средах роста — изменения в темпах роста, размерах клеток и времени морфогенетических событий» (PDF) (132). 1986.
  21. ^ Коэффициенты, ФК; Бернаертс Р. (1994). «CHROMagar Candida, новая дифференциальная изолирующая среда для предполагаемой идентификации клинически важных видов Candida». Журнал клинической микробиологии. 32 (8): 1923–9. PMC 263904. PMID 7989544.
  22. ^ Сими, Винсент. «Происхождение названий видов Candida» (PDF).
  23. ^ МакКул, Логан. «Открытие и наименование Candida albicans» (PDF).
  24. ^ Ремер Т, Цзян Б, Дэвисон Дж, Кетела Т, Вейлетт К, Бретон А, Тандиа Ф, Линто А, Силлаотс С, Марта С, Мартель Н, Веронно С, Лемье С, Кауфман С, Беккер Дж, Штормс Р, Бун C, Bussey H (2003l). «Масштабная идентификация основных генов у Candida albicans и их применение для открытия противогрибковых препаратов». Мол Микробиол. 38 (19): 167–81. doi : 10.1046 / j.1365-2958.2003.03697.x. PMID 14507372.
  25. ^ Перейти к: a b «Новости сообщества Кандида». www.candidagenome.org .
  26. ^ «Штаммы Candida». www.candidagenome.org .
  27. ^ Rustchenko-Bulgac, EP (1991). «Вариации электрофоретических кариотипов Candida albicans». J. Bacteriol. 173 (20): 6586–6596. doi : 10.1128 / jb.173.20.6586-6596.1991. PMC 208996. PMID 1917880.
  28. ^ Холмс, Энн Р.; Цао, Сара; Онг, Су-Ви; Лампинг, Эрвин; Ниими, Кёко; Монах, Брайан С.; Ниими, Масаказу; Канеко, Аки; Голландия, Барбара Р.; Шмид, Ян; Кэннон, Ричард Д. (2006). «Гетерозиготность и функциональная аллельная изменчивость в генах оттока насоса Candida albicans CDR1 и CDR2». Молекулярная микробиология. 62 (1): 170–86. doi : 10.1111 / j.1365-2958.2006.05357.x. PMID 16942600.
  29. ^ Джонс, т.; Федершпиль, NA; Chibana, H.; Dungan, J.; Kalman, S.; Маги, BB; Ньюпорт, Г.; Торстенсон, YR; Agabian, N.; Маги, PT; Дэвис, RW; Шерер С. (2004). «Диплоидная последовательность генома Candida Albicans». Труды Национальной академии наук. 101 (19): 7329–7334. Bibcode : 2004PNAS..101.7329J. doi : 10.1073 / pnas.0401648101. PMC 409918. PMID 15123810.
  30. ^ Охама, Т; Сузуки, Цутому; Мори, Мики; Осава, Сёдзо; Уэда, Такуя; Ватанабэ, Кимицуна; Накасе, Такаши (август 1993 года). «Неуниверсальное декодирование лейцинового кодона CUG у нескольких видов Candida ». Исследование нуклеиновых кислот. 21 (17): 1039–4045. doi : 10.1093 / nar / 21.17.4039. PMC 309997. PMID 8371978.
  31. ^ Арно, МБ; Костанцо, MC; Инглис, DO; Скржипек, МС; Бинкли, Дж.; Шах, П; Бинкли, G; Миясато, SR; Шерлок Дж. «CGD Help: Нестандартные генетические коды».База данных Candida Genome
  32. ^ Анджей (Анджай), Эльзановский и Джим Остелл (7 июля 2010 г.). «Альтернативный дрожжевой ядерный код». Генетические коды. Бетесда, штат Мэриленд, США: Национальный центр биотехнологической информации (NCBI)
  33. ^ Сантос, Массачусетс; Cheesman, C; Коста, V; Морадас-Феррейра, П; Tuite, MF (февраль 1999). «Избирательные преимущества, создаваемые неоднозначностью кодонов, позволили развить альтернативный генетический код в Candida spp. ». Молекулярная микробиология. 31 (3): 937–947. doi: 10.1046 / j.1365-2958.1999.01233.x. PMID a class=»external text» href=»//www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/10048036″ rel=»nofollow»>10048036.
  34. ^ Перейти к: a b Stynen, B; Ван Дейк, P; Турну, Н (октябрь 2010). «Кодон CUG адаптирован к двухгибридной системе для патогенного гриба Candida albicans ». Nucleic Acids Res. 38 (19): с184. doi : 10.1093 / nar / gkq725. PMC 2965261. PMID 20719741.
  35. ^ Перейти к: а б Батлер Г., Расмуссен М.Д., Лин М.Ф. и др. (Июнь 2009 г.) «Эволюция патогенности и полового размножения в восьми геномах Candida ». Природа. 459 (7247): 657–62. Bibcode : 2009Natur.459..657B. doi : 10.1038 / nature08064. PMC 2834264. PMID 19465905.
  36. ^ Сильва Р.М., Паредес Я.А., Моура Г.Р. и др. (Октябрь 2007 г.) «Критические роли изменения генетического кода в эволюции рода Candida ». EMBO J. 26 (21): 4555–65. doi : 10.1038 / sj.emboj.7601876. PMC 2063480. PMID 17932489.
  37. ^ Перейти до: а б Слуцкий, б; Staebell, M; Андерсон, J; Risen, L; Пфальер, М; Soll, DR (1987). « «Белый непрозрачный переход»: вторая высокочастотная система переключения в Candida albicans» (PDF). J. Bacteriol. 1 (169): 189–197. doi : 10.1128 / jb.169.1.189-197.1987. PMC 211752. PMID 3539914.
  38. ^ Слуцкий, Б; Буффо, J; Soll, DR (1985). «Высокочастотное переключение морфологии колоний у Candida albicans». Наука. 230 (4726): 666–9. Bibcode : 1985Sci… 230..666S. doi : 10.1126 / science.3901258. PMID 3901258.
  39. ^ Soll, DR (1992). «Высокочастотное переключение у Candida albicans». Clin Microbiol Rev. 5 (2): 183–203. doi : 10.1128 / cmr.5.2.183. PMC 358234. PMID 1576587.
  40. ^ [1] Фосс, С. (2013, 22 июля). Грибковые микроорганизмы албиканс с сайта https://microbewiki.kenyon.edu/index.php/Candida_albicans#References
  41. ^ Станишевская, М; Бондарик, М; Siennicka, K; Kurzatkowski, W (2012). «Ультраструктура плейоморфных форм Candida albicans: фазово-контрастная микроскопия, сканирующая и просвечивающая электронная микроскопия». Польский журнал микробиологии. 61 (2): 129–35. PMID 23163212.
  42. ^ Si H, Hernday AD, Hirasawa MP, Johnson AD, Bennett RJ (2013). «Белые и непрозрачные клетки Candida albicans проходят различные программы нитевидного роста». PLoS Pathog. 9 (3): e1003210. doi : 10.1371 / journal.ppat.1003210. PMC 3591317. PMID 23505370.
  43. ^ Питер Э. Садбери (2011). «Рост гиф Candida albicans» (PDF). Природа Отзывы Микробиология. 9 (10): 737–748. doi : 10.1038 / nrmicro2636. PMID 21844880.Смотрите рисунок 2.
  44. ^ Sudbery, P; Гоу, N; Берман, J (2004). «Отличительные морфогенные состояния Candida albicans». Тенденции в микробиологии. 12 (7): 317–24. doi : 10.1016 / j.tim.2004.05.008. PMID 15223059.
  45. ^ Хименес-Лопес, Клаудия; Lorenz, Michael C. (2013). «Уклонение от грибкового иммунитета в модельном взаимодействии хозяина и патогена: Candida albicans против макрофагов». Уничтожает патогенные микроорганизмы. 9 (11): e1003741. doi : 10.1371 / journal.ppat.1003741. PMC 3836912. PMID 24278014.
  46. ^ Берман J, Sudbery PE (2002). «Candida Albicans: молекулярная революция, построенная на уроках почкующихся дрожжей». Природа Отзывы Генетика. 3 (12): 918–930. doi : 10.1038 / nrg948. PMID 12459722.
  47. ^ Shareck, J.; Belhumeur, P. (2011). «Модуляция морфогенеза у Candida albicans различными малыми молекулами». Эукариотическая клетка. 10 (8): 1004–12. doi : 10.1128 / EC.05030-11. PMC 3165445. PMID 21642508.
  48. ^ Staib P, Morschhäuser J (2007). «Образование хламидоспор у Candida albicans и Candida dubliniensis — загадочная программа развития». Микозы. 50 (1): 1–12. doi : 10.1111 / j.1439-0507.2006.01308.x. PMID 17302741.
  49. ^ Сон, К; Городской, С; Бруннер, Н; Rupp, S (2003). «EFG1 является основным регулятором динамики клеточной стенки у Candida albicans, обнаруживаемой с помощью микрочипов ДНК». Молекулярная микробиология. 47 (1): 89–102. doi : 10.1046 / j.1365-2958.2003.03300.x. PMID 12492856.
  50. ^ Шапиро, РС; Robbins, N.; Cowen, LE (2011). «Нормативные схемы, регулирующие развитие грибков, лекарственную устойчивость и болезни». Микробиология и молекулярная биология. 75 (2): 213–67. doi : 10.1128 / MMBR.00045-10. PMC 3122626. PMID 21646428.
  51. ^ Soll DR (2014). «Роль фенотипического переключения в базовой биологии и патогенезе Candida albicans». J Устный Микробиол. 6 (2): 895–9. doi : 10.3402 / jom.v6.22993. PMC 3895265. PMID 24455104.
  52. ^ Soll, DR (1 апреля 1992 г.). «Высокочастотное переключение у Candida albicans». Клиническая микробиология Отзывы. 5 (2): 183–203. doi : 10.1128 / cmr.5.2.183. ISSN 0893-8512. PMC 358234. PMID 1576587.
  53. ^ Алби К, Беннетт Р.Дж. (2009). «Переключаться или не переключаться? Фенотипическое переключение чувствительно к множественным воздействиям патогенного гриба» (PDF). Комм Интегр Биол. 2 (6): 509–511. doi : 10.1091 / mbc.E09-01-0040. PMC 2710840. PMID 19458191.
  54. ^ Слуцкий, Б; Буффо, J; Soll, DR (1985). «Высокочастотное переключение морфологии колоний у Candida albicans». Наука. 230 (4726): 666–9. Bibcode : 1985Sci… 230..666S. doi : 10.1126 / science.3901258. PMID 3901258.
  55. ^ Vargas K, Wertz PW, Drake D, Morrow B, Soll DR (1994). «Различия в адгезии клеток Candida albicans 3153A, демонстрирующих смену фенотипа на эпителий ротовой полости и роговой слой». Infect. Иммун. 62 (4): 1328–1335. PMC 186281. PMID 8132340.
  56. ^ Перейти к: а б Тао Л, Ду Х, Гуан Г, Дай Й, Нобиле С, Лян В, Цао С, Чжан К, Чжун Дж, Хуан Г (2014). «Открытие« белой-серо-непрозрачной »системы нестабильного фенотипического переключения у Candida albicans: роли негенетического разнообразия в адаптации хозяина». PLoS Biol. 12 (4): e1001830. doi : 10.1371 / journal.pbio.1001830. PMC 3972085. PMID 24691005.
  57. ^ Перейти к: a b Риккерринк E, Magee B, Magee P (1988). «Непрозрачно-белый фенотипический переход: запрограммированный морфологический переход у Candida albicans». J. Bacteriol. 170 (2): 895–899. doi : 10.3402 / jom.v6.22993. PMC 210739. PMID 2828333.
  58. ^ Лозе М.Б., Джонсон А.Д. (2009). «Белоснежное переключение у Candida albicans». Курр Опин Микробиол. 12 (6): 650–654. doi : 10.1016 / j.mib.2009.09.010. PMC 2812476. PMID 19853498.
  59. ^ Hnisz D, Tscherner M, Kuchler K (2011). Непрозрачно-белый фенотипический переход: запрограммированный морфологический переход у Candida albicans. Методы Мол. Биол. Методы молекулярной биологии. 734. С. 303–315. doi : 10.1007 / 978-1-61779-086-7_15. ISBN 978-1-61779-085-0. PMID 21468996.
  60. ^ Morschhäuser J (2010). «Регуляция бело-непрозрачного переключения у Candida albicans». Мед Микробиол Иммунол. , 199 (3): 165–172. doi : 10.1007 / s00430-010-0147-0. PMID 20390300.
  61. ^ Sonneborn A, Tebarth B, Ernst J (1999). «Контроль бело-непрозрачного фенотипического переключения у Candida albicans с помощью морфогенетического регулятора Efg1p». Инфекция и иммунитет. 67 (9): 4655–4660. PMC 96790. PMID 10456912.
  62. ^ Srikantha T, Tsai L, Daniels K, Soll D (2000). «Нулевые мутанты Candida albicans EFG1 переключаются, но не могут экспрессировать полный фенотип почкующихся клеток белой фазы». J. Bacteriol. 182 (6): 1580–1591. doi : 10.1128 / JB.182.6.1580-1591.2000. PMC 94455. PMID 10692363.
  63. ^ Панде, Калян; Чен, Чанбинь; Noble, Suzanne M (2013). «Проход через кишечник млекопитающего вызывает фенотипическое переключение, которое способствует развитию комменсализма Candida albicans». Генетика природы. 45 (9): 1088–91. doi : 10.1038 / нг. 2710. PMC 3758371. PMID 23892606.
  64. ^ Благородный, Сюзанна М.; Джанетти, Бретань А.; Уитчли, Джессика Н. (2016). «Переключение типа клеток Candida albicans и функциональная пластичность у хозяина млекопитающего». Природа Отзывы Микробиология. 15 (2): 96–108. doi : 10.1038 / nrmicro.2016.157. PMC 5957277. PMID 27867199.
  65. ^ Перейти к: а б Броснахан, Мэнди (22 июля 2013 г.). «Кандида Альбиканс». MicrobeWiki. Кеньон Колледж.
  66. ^ Сиднор, Эмили (24 января 2011 года). «Больничная эпидемиология и инфекционный контроль в условиях неотложной помощи». Клиническая микробиология Отзывы. 24 (1): 141–173. doi : 10.1128 / CMR.00027-10. PMC 3021207. PMID 21233510.
  67. ^ Сарди, JCO (2016-04-16). «Виды Candida: современная эпидемиология, патогенность, образование биопленок, натуральные противогрибковые продукты и новые терапевтические возможности» (PDF). Журнал медицинской микробиологии. 62 (часть 1): 10–24. doi : 10.1099 / jmm.0.045054-0. PMID 23180477 .
  68. ^ Тортора, Функе, Кейс. Микробиология, Введение 10-е издание. Пирсон Бенджамин Каммингс. 2004,2007,2010
  69. ^ Васкес, Хосе (2016-04-16). «Эпидемиология, лечение и профилактика инвазивного кандидоза». Medscape.org. Medscape.
  70. ^ Задик Иегуда; Бернштейн Саар; Деразне Эстелла; Сандлер Вадим; Янкулович Клариэль; Гальперин Тамар (март 2010). «Колонизация Candida: распространенность среди иммунокомпетентных взрослых с пирсингом на языке и без пирсинга». Устный Дис. 16 (2): 172–5. doi : 10.1111 / j.1601-0825.2009.01618.x. PMID 19732353.
  71. ^ Райан KJ, Рэй CG, ред. (2004). Шеррис Медицинская микробиология (4-е изд.). Макгроу Хилл. ISBN 978-0-8385-8529-0.
  72. ^ Тортора, Джеральд, J. (2010). Микробиология: введение. Сан-Франциско, Калифорния: Пирсон Бенджамин Каммингс. п. +759.
  73. ^ Мукерджи П.К., Сендид Б., Хорау Г., Коломбел Д.Ф., Пулен Д., Ганнум М.А. (2015). «Микобиота при желудочно-кишечных заболеваниях». Нат Рев Гастроэнтерол Гепатол. 12 (2): 77–87. doi : 10.1038 / nrgastro.2014.188. PMID 25385227.
  74. ^ Питерс, Брайан М.; Джабра-Ризк, Мэри Энн; Scheper, Mark A.; Лейд, Джефф Дж.; Костертон, Джон Уильям; Shirtliff, Mark E. (2010). «Микробные взаимодействия и дифференциальная экспрессия белка в биопленках Staphylococcus aureus – Candida albicansdual». FEMS Иммунология и Медицинская Микробиология. 59 (3): 493–503. doi : 10.1111 / j.1574-695X.2010.00710.x. PMC 2936118. PMID 20608978.
  75. ^ Лин, Йи Джи; Алсад, Лина; Фогель, Фабио; Коппар, Шардул; Неварез, Лесли; Огюст, Фабрис; Сеймур, Джон; Сайед, Аиша; Кристоф, Кристина; Лумис, Джошуа С. (2013). «Взаимодействие между Candida albicans и Staphylococcus aureus в биопленках смешанных видов». Биос. 84 : 30–39. doi : 10.1893 / 0005-3155-84.1.30.
  76. ^ Заго, Chaiene Evelin; Сильва, Соня; Санита, Паула Вольпато; Барбугли, Паула Абуд; Диас, Карла Мария Хитрэта; Лорделло, Вирджиния Баррето; Вергани, Карлос Эдуардо (2015). «Динамика образования биопленки и взаимодействие между Candida albicans и метициллин-восприимчивым (MSSA) и устойчивым золотистым стафилококком (MRSA)». PLOS One. 10 (4): e0123206. Bibcode : 2015PLoSO..1023206Z. doi : 10.1371 / journal.pone.0123206. PMC 4395328. PMID 25875834.
  77. ^ Тортора, Джеральд, J. (2010). Мибробиология: введение. Сан-Франциско, Калифорния: Пирсон Бенджамин Каммингс. п. +758.
  78. ^ Вайнбергер, М (2016-04-16). «Характеристики кандидемии с Candida-albicans по сравнению с не-albicans видами Candida и предикторами смертности». J Hosp Infect. 61 (2): 146–54. doi : 10.1016 / j.jhin.2005.02.009. PMID 16009456.
  79. ^ Япар, Нур (2016-04-16). «Эпидемиология и факторы риска инвазивного кандидоза». Давресс. 10 : 95–105. doi : 10.2147 / TCRM.S40160. PMC 3928396. PMID 24611015.
  80. ^ «Грибковые заболевания». Центры по контролю и профилактике заболеваний, Центры по контролю и профилактике заболеваний, 12 июня 2015 г., www.cdc.gov/fungal/diseases/candidiasis/invasive/diagnosis.html.
  81. ^ «Дрожжи». www.microbiologybook.org
  82. ^ Пулен Д; и другие. (2009). «Дрожжи: забытые патогены». Пищеварительные заболевания. 27 Suppl 1: 104–110. doi : 10.1159 / 000268129. ISSN 1421-9875. PMID 20203505.
  83. ^ Джавхара, Самир; Пулен, Даниэль (январь 2007). «Saccharomyces boulardiide уменьшает воспаление и кишечную колонизацию Candida albicansin на мышиной модели химически индуцированного колита». Медицинская микология. 45 (8): 691–700. doi : 10.1080 / 13693780701523013. ISSN 1369-3786. PMID 17885943.
  84. ^ Джавхара С; и другие. (Апрель 2008 г.) «Колонизация мышей кандида-альбиканс, вызванная химически индуцированным колитом и усиливающая воспалительные реакции посредством галектина-3». Журнал инфекционных заболеваний. 197 (7): 972–980. doi : 10.1086 / 528990. ISSN 0022-1899. PMID 18419533.
  85. ^ Перейти к: a b Sellama A, Whiteway M (2016). «Последние достижения в области биологии и вирулентности Candida albicans». F1000Res. 5 : 7. doi : 10.12688 / f1000research.9617.1. PMC 5089126. PMID 27853524.
  86. ^ «Редакция: Хватит пренебрегать грибами». Микробиология природы. 2 (8): 17120. 25 июля 2017 года. Doi : 10.1038 / нМикробиол.2017.120. PMID 28741610 .
  87. ^ Rambach, G; Оберхаузер, Н; Спет, С; Lass-Flörl, C (2011). «Восприимчивость видов Candida и различных плесеней к противогрибковым препаратам: использование эпидемиологических предельных значений в соответствии с EUCAST и CLSI в 8-летнем исследовании». Медицинская микология: официальная публикация Международного общества по микологии человека и животных. 49 (8): 856–63. doi : 10.3109 / 13693786.2011.583943. PMID 21619497.
  88. ^ Тортора. Микробиология Введение (10-е изд.). Сан-Франциско, Калифорния: Пирсон Бенджамин Каммингс. п. +759.
  89. ^ «Противогрибковая резистентность — грибковые заболевания — CDC». www.cdc.gov. 26 июня 2017 .
  90. ^ «Хватит пренебрегать грибами». От редакции. Микробиология природы. 2 (8): 17120. 25 июля 2017 года. Doi : 10.1038 / нМикробиол.2017.120. PMID 28741610.
  91. ^ Уппулури, Прия; Хан, Афшин; Эдвардс, Джон Э. (2017). «Современные тенденции в кандидозе». В Прасаде, Раджендра. Candida albicans: клеточная и молекулярная биология. Швейцария: Springer International Publishing AG. п. 6. ISBN 978-3-319-50408-7.
  92. ^ Уилсон, Лесли С.; Рейес, Каролина М.; Столпман, Мишель; Спекман, Джули; Аллен, Каролина; Беней, Джонни (2002). «Прямые затраты и частота системных грибковых инфекций». Ценность в здоровье. 5 (1): 26–34. doi : 10.1046 / j.1524-4733.2002.51108.x. PMID 11873380.
  93. ^ Рентц, AM; Halpern, MT; Боуден Р. (1998). «Влияние кандидемии на продолжительность пребывания в больнице, исход и общую стоимость заболевания». Клинические инфекционные заболевания. 27 (4): 781–8. doi : 10.1086 / 514955. PMID 9798034.
  94. ^ Вила, Таисса Виейра Мачадо; Розенталь, Соня (2016). Грибковая патогенность. InTech. doi : 10,5772 / 62768. ISBN 978-953-51-2394-1.
  95. ^ Финкель, Джонатан С.; Митчелл, Аарон П. (2011). «Генетический контроль развития биопленки Candida albicans». Природа Отзывы Микробиология. 9 (2): 109–118. doi : 10.1038 / nrmicro2475. ISSN 1740-1534. PMC 3891587. PMID 21189476.
  96. ^ Клаус, Джулиана; Чаваррия-Краузер, Андрес (2012-06-08). «Моделирование регулирования поглощения цинка с помощью ЗИП транспортеров в корнях дрожжей и растений». PLOS One. 7 (6): с37193. arXiv : 1202.4335. Bibcode : 2012PLoSO… 737193C. doi : 10.1371 / journal.pone.0037193. ISSN 1932-6203. PMC 3371047. PMID 22715365.
  97. ^ Азадманеш, Джахаун; Говен, Остин М.; Creger, Paul E.; Schafer, Nichole D.; Бланкеншип, Джилл Р. (2017). «Филаментация включает две перекрывающиеся, но отличающиеся друг от друга программы филаментации у патогенного грибка Candida albicans». G3: Гены, Геном, Генетика. 7 (11): 3797–3808. DOI : 10,1534 / g3.117.300224. PMC 5677161. PMID 28951491.
  98. ^ Лоренц, М. С; Бендер, J. A; Финк, Г. Р (2004). «Транскрипционный ответ Candida albicans на интернализацию макрофагами». Эукариотическая клетка. 3 (5): 1076–87. doi : 10.1128 / EC.3.5.1076-1087.2004. PMC 522606. PMID 15470236.
  99. ^ Стааб, JF (1999). «Адгезивные и субстратные свойства трансглутаминазы млекопитающих Candida albicans Hwp1». Наука. 283 (5407): 1535–1538. Bibcode : 1999Sci… 283.1535S. doi : 10.1126 / science.283.5407.1535. ISSN 0036-8075.
  100. ^ Ариячет, С.; Солис, НВ; Лю, Y.; Прасадарао, НВ; Наполнитель, SG; McBride, AE (2013). «SR-подобный РНК-связывающий белок Slr1 влияет на филаментацию и вирулентность Candida albicans». Инфекция и иммунитет. 81 (4): 1267–1276. doi : 10.1128 / IAI.00864-12. ISSN 0019-9567. PMC 3639594. PMID 23381995.
  101. ^ Дункан Уилсон; Джулиан Р. Наглик; Бернхард Хубе (2016). «Недостающее звено между морфогенезом Candida albicans Hyphal и повреждением клеток-хозяев». PLoS Pathog. 12 (10): e1005867. doi : 10.1371 / journal.ppat.1005867. PMC 5072684. PMID 27764260.
  102. ^ Шен, J; Го, W; Колер, J. R (2005). «CaNAT1, гетерологичный доминантный селектируемый маркер для трансформации Candida albicans и других патогенных видов Candida». Инфекция и иммунитет. 73 (2): 1239–42. doi : 10.1128 / IAI.73.2.1239-1242.2005. PMC 547112. PMID 15664973.
  103. ^ Cheng, S; Нгуен, М. Н; Чжан, Z; Цзя, Н; Хэндфилд, М; Clancy, C. J (2003). «Оценка роли четырех генов Candida albicans в вирулентности с использованием штаммов с нарушением генов, которые экспрессируют URA3 из нативного локуса». Инфекция и иммунитет. 71 (10): 6101–3. doi : 10.1128 / IAI.71.10.6101-6103.2003. PMC 201070. PMID 14500538.
  104. ^ Благородный, С. М; Джонсон А.Д. (2005). «Штаммы и стратегии для крупномасштабных исследований делеции генов диплоидного грибкового патогена человека Candida albicans». Эукариотическая клетка. 4 (2): 298–309. doi : 10.1128 / EC.4.2.298-309.2005. PMC 549318. PMID 15701792.
  105. ^ Стинен, Брэм; Ван Дейк, Патрик; Турну, Элен (2010). «Кодон CUG адаптирован к двухгибридной системе для патогенного гриба Candida albicans». Исследование нуклеиновых кислот. 38 (19): с184. doi : 10.1093 / nar / gkq725. PMC 2965261. PMID 20719741.
  106. ^ Ван Хет Хуг, Марко; Раст, Тимоти Дж; Мартченко Михаил; Гриндл, Сюзанна; Динард, Даниэль; Хогес, Эрве; Куомо, Кристина; Берриман, Мэтью; Шерер, Стюарт; Маги, BB; Whiteway, Malcolm; Чибана, Хироджи; Нантель, Андре; Маги, PT (2007). «Сборка генома Candida albicans в шестнадцать суперконтигов, выровненных по восьми хромосомам». Геном Биология. 8 (4): R52. doi : 10.1186 / gb-2007-8-4-r52. PMC 1896002. PMID 17419877.
  107. ^ Кабрал, Витор; Шовель, Мюриэль; Фирон, Арно; Легран, Мелани; Несейр, Одри; Бачелье-Басси, Софи; Чаудхари, Йогеш; Мунро, Кэрол А.; д’Энферт, Кристоф (2012). «Модульные стратегии сверхэкспрессии генов для Candida albicans». В бренде Александра C.; МакКаллум, Донна М. Взаимодействия между хозяином и грибком — стратегии сверхэкспрессии модульных генов для Candida albicans, Методы молекулярной биологии. Методы молекулярной биологии. 845. С. 227–44. doi : 10.1007 / 978-1-61779-539-8_15. ISBN 978-1-61779-538-1. PMID 22328378.
  108. ^ Шовель, Мюриэль; Несейр, Одри; Кабрал, Витор; Знайди, Садри; Гоард, Софи; Бачелье-Басси, Софи; Фирон, Арно; Легран, Мелани; Диого, Доротея; Naulleau, Клэр; Россиньол, Тристан; д’Энферт, Кристоф (2012). «Универсальная стратегия сверхэкспрессии в патогенных дрожжах Candida albicans: идентификация регуляторов морфогенеза и приспособленности». PLOS One. 7 (9): с45912. Bibcode : 2012PLoSO… 745912C. doi : 10.1371 / journal.pone.0045912. PMC 3457969. PMID 23049891.
  109. ^ Перейти к: в б Уокер, Луиза А.; МакКаллум, Донна М.; Бертрам, Гвинет; Гоу, Нил АР; Шансы, франк с.; Браун, Алистер Дж.П. (2009). «Геномный анализ паттернов экспрессии генов Candida albicans при заражении почек млекопитающих». Грибковая генетика и биология. 46 (2): 210–9. doi : 10.1016 / j.fgb.2008.10.012. PMC 2698078. PMID 19032986.
  110. ^ Стинен, Брэм; Ван Дейк, Патрик; Турну, Элен (2010). «Кодон CUG адаптирован к двухгибридной системе для патогенного гриба Candida albicans». Исследование нуклеиновых кислот. 38 (19): с184. doi : 10.1093 / nar / gkq725. PMC 2965261. PMID 20719741.
  111. ^ Легран, Мелани; Бачелье-Басси, Софи; Ли, Кеунсук К; Чаудхари, Йогеш; Турну, Элен; Арбогаст, Лоуренс; Бойер, Элен; Шовель, Мюриэль; Кабрал, Витор; Мофрей, Коринн; Несейр, Одри; Масланка, Ирена; Пермаль, Эммануэль; Россиньол, Тристан; Уокер, Луиза А; Zeidler, Ute; Знайди, Садри; Скутерс, Флорис; Маджер, Шарлотта; Жюльен, Рено А; Ма, Лоуренс; Тичит, Магали; Башиер, Кристиан; Ван Дейк, Патрик; Мунро, Кэрол А; д’Энферт, Кристоф (6 июля 2018 года). «Создание геномных платформ для изучения патогенеза Candida albicans». Исследование нуклеиновых кислот. 46 (14): 6935–6949. doi : 10.1093 / nar / gky594. ISSN 0305-1048. PMC 6101633. PMID 29982705.
  112. ^ Schoeters, F; Munro, C. A; д’Энферт, С; Ван Дейк, P (2018). «Высокопроизводительная двухгибридная система Candida albicans». мСфера. 3 (4). doi : 10.1128 / mSphere.00391-18. PMC 6106057. PMID 30135223.
  113. ^ Лаборатория, Майк Тайерс. «BioGRID — база данных белковых, химических и генетических взаимодействий». thebiogrid.org.
  114. ^ Суботич, Ана; Свиннен, Эрвин; Демьюсер, Лизбет; Де Керсмекер, Херлинде; Мидзуно, Хидеаки; Турну, Элен; Ван Дейк, Патрик (2017). «Бимолекулярный флуоресцентный комплементарный инструмент для идентификации белково-белковых взаимодействий у Candida albicans». G3: гены, геномы, генетика. 7 (10): 3509–3520. DOI : 10,1534 / g3.117.300149. PMC 5633398. PMID 28860184.
  115. ^ Мочон, А. Брайан; Йе, Джин; Каяла, Мэтью А.; Wingard, John R.; Клэнси, Корнелиус Дж.; Нгуен, М. Хонг; Фельгнер, Филипп; Балди, Пьер; Лю, Haoping (2010). «Серологическое профилирование белкового микрочипа Candida albicans выявляет постоянное взаимодействие хозяина с патогеном и специфические реакции на стадии при кандидемии». Уничтожает патогенные микроорганизмы. 6 (3): e1000827. doi : 10.1371 / journal.ppat.1000827. PMC 2845659. PMID 20361054.
  116. ^ Ремер, Терри; Цзян Бо Дэвисон, Джон; Кетела, Трой; Veillette, Karynn; Бретон, Анук; Тандиа, Фату; Линто, Энни; Силлаотс, Сьюзен; Марта, Катарина; Мартель, Ник; Веронно, Стив; Лемье, Себастьян; Кауфман, Сара; Беккер, Джефф; Буря, Реджинальд; Бун, Чарльз; Bussey, Howard (2003). «Масштабная идентификация основных генов у Candida albicans и их применение для открытия противогрибковых препаратов». Молекулярная микробиология. 50 (1): 167–81. doi : 10.1046 / j.1365-2958.2003.03697.x. PMID 14507372.
  117. ^ Дин, Нета; Нг, Генри (2018). «Метод мутагенеза CRISPR / Cas9 у Candida albicans». Био-протокол. 8 (8). doi : 10.21769 / BioProtoc.2814.
  118. ^ Vyas, В. K; Барраса, М. I; Финк Г.Р. (2015). «Система Candis albicans CRISPR позволяет осуществлять генную инженерию важных генов и семейств генов». Научные достижения. 1 (3): e1500248. Bibcode : 2015SciA…. 1E0248V. doi : 10.1126 / sciadv.1500248. PMC 4428347. PMID 25977940.
  119. ^ Мин, Кёнхун; Итикава, Юичи; Вулфорд, Кэрол А; Митчелл, Аарон П (2016). «Удаление гена Candida albicans с помощью временной системы CRISPR-Cas9». мсфера. 1 (3). doi : 10.1128 / mSphere.00130-16. PMC 4911798. PMID 27340698.
  120. ^ Ди Джакомо, Раффаэле; Мареска, Бруно; Порта, Амалия; Сабатино, Паоло; Карапелла, Джованни; Найтцерт, Хайнц-Кристоф (2013). «Candida albicans / MWCNTs: стабильный проводящий био-нанокомпозит и его термочувствительные свойства». IEEE Сделки по нанотехнологиям. 12 (2): 111–114. Bibcode : 2013ITNan..12..111D. doi : 10.1109 / TNANO.2013.2239308.


Поделиться:

1 комментарий

  1. Вагинальную грибковую (дрожжевую) инфекцию вызывают грибки рода Кандида (Candida). Влагалище в норме содержит сбалансированное сочетание микрофлоры, включая кандиды и бактерии. Лактобациллы выделяют кислоту, которая предупреждает избыточный рост грибков. Этот баланс может быть нарушен и способен привести к кандидозу.

Добавить комментарий

Ваш e-mail не будет опубликован. Обязательные поля помечены *